COVID long et CIRS : les moisissures en cause ?

Le COVID long et le CIRS (syndrome de réponse inflammatoire chronique) peuvent se ressembler beaucoup. Les deux provoquent de la fatigue, un brouillard cérébral, des maux de tête, des douleurs et des troubles respiratoires qui durent des mois. Mais ce sont des diagnostics différents.

Le COVID long suit une infection par le SARS-CoV-2, le virus responsable du COVID-19. Le CIRS, tel que le définit le groupe du Dr Ritchie Shoemaker, suit une exposition à des biotoxines. Les biotoxines sont des poisons naturels fabriqués par des êtres vivants comme les moisissures. Le plus souvent, elles viennent de l’air intérieur de bâtiments endommagés par l’eau.

Une seule petite étude a examiné les deux ensemble. Elle venait du propre groupe du Dr Shoemaker, et personne d’autre n’a confirmé ses résultats. Elle soulève pourtant une question pratique si vous ne vous êtes pas rétabli : suis-je encore exposé à un bâtiment humide et moisi ?

Qu’est-ce que le COVID long ?

L’Organisation mondiale de la santé (OMS) appelle le COVID long affection post-COVID-19. Des experts internationaux se sont accordés sur sa définition chez l’adulte lors d’un processus de consensus structuré, appelé méthode Delphi [1]. En termes simples, le COVID long signifie que :

• vous avez eu une infection par le SARS-CoV-2 probable ou confirmée,
• l’affection est en général présente 3 mois après le début de l’infection,
• les symptômes durent au moins 2 mois, et
• aucun autre diagnostic ne les explique [1].

Les symptômes compliquent en général la vie quotidienne. Ils peuvent commencer alors que vous sembliez guéri, ou prolonger directement l’infection. Ils peuvent aller et venir, ou revenir [1].

Bien étudié L’OMS estime qu’environ 6 personnes sur 100 qui attrapent le COVID-19 développent un COVID long. Ce taux semble plus faible aujourd’hui qu’au début de la pandémie [2].

Plus de 200 symptômes ont été signalés. Les plus fréquents sont [2, 3] :

• la fatigue
• les douleurs musculaires ou articulaires
• l’essoufflement
• les maux de tête
• les troubles de la réflexion, souvent appelés « brouillard cérébral »
• les changements du goût
• les troubles du sommeil
• la dépression et l’anxiété

Existe-t-il un test du COVID long ?

Non. En 2024, les National Academies américaines, un organisme qui réunit des scientifiques de premier plan, ont décrit le COVID long comme une maladie chronique associée à une infection, qui dure depuis au moins 3 mois. Elles ont ajouté deux points importants ici [4] :

• Aucun biomarqueur ne peut confirmer un COVID long. Un biomarqueur est quelque chose que l’on peut mesurer dans le corps, comme une valeur sanguine, et qui révèle une maladie. Aucun de ceux disponibles aujourd’hui ne tranche la question.
• Le COVID long peut coexister avec d’autres maladies. Ce n’est pas un diagnostic que l’on reçoit seulement après avoir tout écarté.

Quelles sont les causes du COVID long ?

Recherche préliminaire Personne ne le sait encore, et il y a probablement plusieurs causes. L’OMS et des revues de la recherche citent ces pistes principales [2, 3] :

• du virus qui reste dans les tissus du corps
• un système immunitaire déséquilibré
• d’autres virus qui se réveillent, comme le virus d’Epstein-Barr
• l’auto-immunité, quand le système immunitaire attaque les tissus du corps
• des changements dans les bactéries de l’intestin (le microbiote intestinal)
• des problèmes dans les petits vaisseaux sanguins

On estime qu’environ la moitié des personnes atteintes de COVID long remplissent les critères de l’EM/SFC (encéphalomyélite myalgique / syndrome de fatigue chronique). Beaucoup ont un malaise post-effort : leurs symptômes s’aggravent après un effort physique ou mental [3].

Les moisissures et les bâtiments endommagés par l’eau ne figurent pas parmi les causes discutées dans ces sources de référence [2, 3]. Cela ne veut pas dire qu’ils sont sans importance. Cela veut dire qu’ils ont été à peine étudiés.

Un COVID long peut-il être un CIRS ?

Le COVID long est, par définition, lié à un virus. Les virus ne sont pas des biotoxines. Dans le modèle du Dr Shoemaker, un virus ne déclenche pas à lui seul un CIRS (voir ce qui déclenche le CIRS).

La vraie question n’est donc pas de savoir si le COVID-19 « est » un CIRS. Il y a deux autres possibilités :

1. Certaines personnes qui restent malades après le COVID-19 ont aussi un CIRS, dû à une exposition présente depuis le début.
2. L’infection a fait basculer un système immunitaire déjà sous pression.

Avis d’expert La deuxième idée est une hypothèse : une idée qui n’a pas été testée. Une revue de 2024 rédigée par des praticiens du CIRS range le COVID long parmi les « affections potentiellement liées au CIRS » et demande qu’il soit étudié [5]. C’est une description honnête de l’état des connaissances.

Qu’a trouvé l’étude de Shoemaker sur le syndrome post-COVID ?

Une petite étude En 2021, le Dr Shoemaker et ses collègues ont publié une étude observationnelle dans Medical Research Archives [6]. Observationnelle signifie que les chercheurs ont fait des mesures sur des personnes. Ils ne les ont pas soignées et n’ont pas testé de traitement.

Qui a été étudié : 21 personnes testées positives puis négatives au COVID-19. Elles ont été recrutées dans des cabinets médicaux. 14 ne s’étaient pas rétablies six semaines après le test négatif. L’étude les appelle « PCS+ » (syndrome post-COVID). 7 s’étaient rétablies (« PCS− »).

Ce qui a été mesuré :

• les symptômes
• le test de sensibilité aux contrastes visuels (VCS), un test de la vision qui mesure votre capacité à distinguer des nuances de gris
• le GENIE, une analyse de sang commerciale de l’activité des gènes (quels gènes sont allumés). Il a été mis au point pour le CIRS.

Les chercheurs ont comparé les deux groupes entre eux, avec des patients atteints de CIRS et avec des témoins en bonne santé.

Ce qu’ils ont trouvé :

	Non rétablis (14 personnes)	Rétablis (7 personnes)
Nombre moyen de symptômes	18,2	8,2
Test VCS anormal	75 % (environ 3 sur 4)	aucun
Profil génétique que le groupe appelle « hypométabolisme moléculaire »	tous	aucun
Marqueurs génétiques interprétés comme une exposition aux actinobactéries	57 % (environ 6 sur 10)	14 % (environ 1 sur 7)
Marqueurs génétiques interprétés comme une exposition aux endotoxines	64 % (environ 2 sur 3)	0 %

Les actinobactéries sont des bactéries qui poussent en filaments comme les moisissures. Les endotoxines sont des éléments de la paroi de certaines bactéries. Les deux sont typiques de l’air intérieur des bâtiments endommagés par l’eau. « Hypométabolisme moléculaire » est le nom que le groupe donne lui-même à un profil d’activité des gènes ; il suggère que les cellules tournent au ralenti, mais c’est leur interprétation.

Ce que l’étude n’a pas fait :

• Aucun bâtiment n’a été inspecté ni échantillonné. L’exposition à un dégât des eaux a été déduite de profils génétiques dans le sang. Elle n’a pas été mesurée.
• Aucun traitement n’a été donné.

Les auteurs ont conclu que le syndrome post-COVID pourrait survenir chez des personnes ayant d’autres expositions environnementales, et que d’autres études sont nécessaires [6].

Quel poids peut-on accorder à cette étude ?

Pas beaucoup, à elle seule.

• Elle est petite : 14 personnes comparées à 7.
• Rien n’a été mesuré dans l’environnement.
• La plupart des auteurs travaillent sur le CIRS.
• Le test principal a été conçu pour le CIRS. L’un des auteurs travaille pour l’entreprise qui l’a mis au point, et il n’a pas été vérifié de façon indépendante pour cet usage.
• La revue n’est pas indexée dans PubMed, la principale base de données de la recherche médicale.
• Personne ne l’a reproduite. En octobre 2026, nous n’avons trouvé aucune étude indépendante ayant testé un lien entre COVID long et bâtiments endommagés par l’eau.

L’étude est une raison de poser la question. Elle n’y répond pas.

Comment le COVID long et le CIRS se comparent-ils ?

	COVID long (affection post-COVID-19)	CIRS (définition de Shoemaker)
Point de départ	Infection par le SARS-CoV-2 ; l’affection est en général présente 3 mois après son début [1]	Exposition à des biotoxines, le plus souvent l’air intérieur de bâtiments endommagés par l’eau [7]
Symptômes typiques	Fatigue, malaise post-effort, essoufflement, brouillard cérébral, douleurs, maux de tête, troubles du sommeil [2, 3]	Fatigue, brouillard cérébral, douleurs, maux de tête, sensibilité à la lumière, symptômes respiratoires et digestifs, engourdissements, soif, décharges électrostatiques [7]
Diagnostic	Diagnostic clinique ; aucun biomarqueur ne le confirme [4]	Symptômes, historique des expositions, marqueurs biologiques (par ex. MSH, MMP-9, TGF-β1, VIP) et test VCS [7]
Principales explications	Virus qui persiste, déséquilibre immunitaire, auto-immunité, microcaillots et autres [2, 3]	Une réaction persistante du système immunitaire inné aux biotoxines chez des personnes génétiquement prédisposées [7]
Approche du traitement	Prise en charge des symptômes, réadaptation, gestion de l’effort ; la recherche sur les traitements est limitée [2]	D’abord mettre fin à l’exposition, puis le protocole Shoemaker étape par étape [5, 7]
Solidité des preuves	Un grand effort de recherche international, mais toujours aucun remède prouvé [2, 3]	Surtout un seul groupe de recherche ; peu d’essais indépendants [5]
Lien entre les deux	Une petite étude du groupe de Shoemaker (21 personnes) [6]	La même étude ; non confirmée par d’autres

Le système immunitaire inné est la première ligne de défense rapide du corps. Les microcaillots sont de minuscules caillots sanguins.

Pourquoi chercher un dégât des eaux si vous ne vous êtes pas remis du COVID-19 ?

Parce que se poser la question coûte peu. Et s’il y a une exposition, vous pouvez agir.

Bien étudié En s’appuyant sur des recherches indépendantes, l’OMS conclut que l’humidité et les moisissures dans les bâtiments augmentent le risque de symptômes respiratoires, d’infections respiratoires et d’aggravation de l’asthme. Elle recommande de prévenir l’humidité persistante et la prolifération microbienne à l’intérieur [8].

Non étudié On ne sait pas si une telle exposition contribue aussi à entretenir le COVID long. Mais vivre ou travailler dans un bâtiment endommagé par l’eau n’est bon pour personne quand on a des symptômes persistants.

La question mérite surtout d’être posée si :

• vos symptômes s’atténuent nettement quand vous êtes loin de chez vous ou du travail pendant plusieurs jours, et reviennent à votre retour
• le bâtiment a des antécédents de fuites, de condensation, d’odeur de moisi ou de moisissure visible, ou d’autres personnes y ont des symptômes semblables (voir les signes d’un dégât des eaux)
• vous aviez déjà de la fatigue, un brouillard cérébral ou des sinusites à répétition avant le COVID-19, et l’infection les a beaucoup aggravés
• vous avez des symptômes typiques du CIRS mais moins typiques du COVID long, comme une forte soif, des envies fréquentes d’uriner, des décharges électrostatiques ou un goût métallique [7]

Rien de tout cela ne prouve quoi que ce soit. Ce sont des raisons d’y regarder de plus près, avec un médecin.

Que faire ensuite ?

Ne commencez pas de vous-même des traitements sur ordonnance comme les séquestrants. Les séquestrants sont des médicaments qui fixent les toxines dans l’intestin. Si un CIRS vous est diagnostiqué, c’est le médecin traitant qui décide des médicaments et des doses.

Qu’est-ce qu’on ne sait pas ?

Il est important d’être honnête sur les lacunes. Les deux maladies attirent des affirmations très assurées sur internet.

• Si le CIRS explique même un seul cas de COVID long. Une étude de 14 personnes non rétablies et de 7 rétablies ne peut pas répondre à cette question [6].
• À quelle fréquence on trouve des dégâts des eaux dans les logements des personnes atteintes de COVID long. Aucune étude n’a inspecté leurs logements pour les comparer à ceux des personnes rétablies.
• Si le traitement du CIRS aide les personnes atteintes de COVID long. Aucun essai n’a testé le protocole Shoemaker dans le COVID long. L’étude de 2021 n’a donné aucun traitement [6], et la revue de 2024 demande que cela soit étudié [5].
• Si les marqueurs du CIRS permettent de distinguer les deux. Des marqueurs comme le MMP-9 et le TGF-β1 mesurent l’inflammation, pas sa cause. Même la déclaration de consensus sur le CIRS dit que les résultats du VCS, les anomalies biologiques ou les symptômes seuls ne suffisent pas pour un diagnostic [7]. Aucune étude n’a testé leur capacité à séparer le CIRS du COVID long.

Si vous avez un COVID long et que quelqu’un a évoqué un CIRS, voici le terrain le plus solide : écarter les causes habituelles, vérifier s’il existe une exposition persistante à un bâtiment endommagé par l’eau, et juger tout diagnostic sur de vrais tests plutôt que sur une liste de symptômes. Le fondateur du site, Joel Hakala, raconte son propre chemin vers un diagnostic dans son histoire avec le CIRS.

À retenir

Testez-vous : pouvez-vous expliquer pourquoi un test VCS anormal ne prouve pas que le COVID long d’une personne est un CIRS ? Et pourquoi l’étude de 2021 ne peut pas montrer que les moisissures entretiennent le COVID long ?

Et ensuite ?

• Lire comment on diagnostique le CIRS.
• Vérifier si vos symptômes s’améliorent loin de chez vous.
• Comparer le CIRS et l’EM/SFC.

Références

1. Soriano JB, Murthy S, Marshall JC, Relan P, Diaz JV; WHO Clinical Case Definition Working Group on Post-COVID-19 Condition. A clinical case definition of post-COVID-19 condition by a Delphi consensus. Lancet Infect Dis. 2022;22(4):e102–e107. PubMed
2. World Health Organization. Post COVID-19 condition (long COVID). Fact sheet, 26 February 2025. Accessed 2 October 2026. WHO
3. Davis HE, McCorkell L, Vogel JM, Topol EJ. Long COVID: major findings, mechanisms and recommendations. Nat Rev Microbiol. 2023;21(3):133–146. PubMed
4. Ely EW, Brown LM, Fineberg HV; National Academies of Sciences, Engineering, and Medicine Committee on Examining the Working Definition for Long Covid. Long Covid defined. N Engl J Med. 2024;391(18):1746–1753. PubMed
5. Dooley M, Vukelic A, Jim L. Chronic inflammatory response syndrome: a review of the evidence of clinical efficacy of treatment. Ann Med Surg (Lond). 2024;86(12):7248–7254. PubMed
6. Shoemaker RC, McMahon SW, Heyman A, Lark D, van der Westhuizen M, Ryan JC. Treatable metabolic and inflammatory abnormalities in Post COVID Syndrome (PCS) define the transcriptomic basis for persistent symptoms: lessons from CIRS. Med Res Arch. 2021;9(7). DOI
7. Shoemaker R, Johnson K, Jim L, et al. Diagnostic process for chronic inflammatory response syndrome (CIRS): a consensus statement report of the Consensus Committee of Surviving Mold. Internal Medicine Review. 2018;4(5):1–47. PDF
8. World Health Organization. WHO guidelines for indoor air quality: dampness and mould. Copenhagen: WHO Regional Office for Europe; 2009. WHO